По благословению митрополита Ярославского и Ростовского Вадима Спасо-Афанасиевскому мужскому монастырю 20 июня 2023 года передан для духовного окормления древний храм Николы Надеина.
В самом начале 20-х годов 17 века, чуть-чуть отойдя от страшной сумятицы Смутного времени, один из богатейших городских купцов решает возвести каменный храм на волжском берегу. Звали этого купца – Епифанием Светешниковым, а вторым его мирским именем было имя Надея, которое и сохранилось в названии возведенного храма. Строить храм Надея пожелал на волжском берегу взамен пострадавшей деревянной Благовещенской церкви. Было это в 1620 году.
После революции в 1930 году церковь закрыта и передана в ведение музея. Но уже в 1935 году главное здание было оценено, как имеющее историческую ценность и стало охраняться государством.
В конце 30-х годов в храме находился музей Ф. Волкова, в годы войны - аптечный склад, а в подклете хранились овощи. В 60-е годы, после включения храма в состав Музея-заповедника, он был открыт для посетителей как музейный храмовый филиал.
Первая служба после длительного перерыва была совершена собором духовенства Спасо-Афанасиевского монастыря 14 июля 2023 года.
Перед богослужением было совершено малое освящение храма.